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作者:荷叶
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“荷叶师兄,教授让我研究新基因XXX的功能,我想问下…”
“小师妹,这个也是有套路的,首先你可以研究XXX在各器官、组织表达谱,其次……,你明白吧?”(师兄迫不及待的向小师妹传授经验之谈)
“哦!”(刚入科的小师妹好像明白怎么做了)
“你可以利用原核、真核表达系统将XXX表达出来研究其功能,再次……,你明白吧?”
“哦?”(小师妹感觉好多东西需要学)
“接下来你可以研究XXX的表达调控,……,你还可以……,你明白吧?师兄我硕士阶段就是这么做的。”
“哦??”(小师妹感觉有点跟不上节奏)……
一个小时后师兄意犹未尽。
“师兄,我就是想问下在NCBI里如何快速、准确找到基因序列。”(小师妹弱弱的说了一句)
“Easy!”荷叶师兄又开始传授经验。
套路一
进入NCBI网站,在Nucleotide(核苷酸)数据库中搜索,以人CCL2为例。
套路二
进入NCBI网站,在CCDS(共识编码序列)数据库中搜索,https://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/CCDS/CcdsBrowse.cgi
套路三(荷叶推荐)
进入NCBI网站,在Gene(基因)数据库中搜索。找到Tools工具的下拉菜单中Sequence Text View,点击就可以查到基因序列,并且网站以不同颜色标注CCL2基因的不同部分,灰色的UTR,红色的外显子,绿色的内含子,以及一一对应的编码区。
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